SluitenHelpPrint
Switch to English
Cursus: SK-B1BIFC
SK-B1BIFC
Biofysische chemie
Cursus informatieRooster
CursuscodeSK-B1BIFC
Studiepunten (ECTS)7,5
Categorie / Niveau1 (Bachelor Inleiding)
CursustypeCursorisch onderwijs
VoertaalNederlands
Aangeboden doorFaculteit Betawetenschappen; Undergraduate School Bètawetenschappen;
Contactpersoonprof. dr. M Baldus
E-mailM.Baldus@uu.nl
Docenten
Contactpersoon van de cursus
prof. dr. M Baldus
Overige cursussen docent
Docent
prof. dr. M Baldus
Overige cursussen docent
Docent
dr. S.A. Jonker
Overige cursussen docent
Docent
prof. dr. W.K. Kegel
Overige cursussen docent
Docent
dr. C.A. van Walree
Overige cursussen docent
Blok
2  (12-11-2018 t/m 01-02-2019)
Aanvangsblok
2
TimeslotBCD: Zie 'Help'
Onderwijsvorm
Voltijd
Cursusinschrijving geopendvanaf 17-09-2018 t/m 30-09-2018
AanmeldingsprocedureOsiris
Inschrijven via OSIRISJa
Inschrijven voor bijvakkersNee
VoorinschrijvingNee
WachtlijstJa
PlaatsingsprocedureStudiepunt/Student desk
Cursusdoelen
Na afronding van de cursus is de student in staat:
·         De relatie tussen moleculaire eigenschappen en spectroscopische methodes begrijpen
·         eenvoudige IR-, Massa- , NMR-spectra interpreteren en voorspellen.
·         Absorptie vs. Emissie: Fluorescentie
·         Conjugated pi-electron systemen en hoe Ultraviolet (UV) spectroscopie deze kan bestuderen.
·         De relatie tussen energieën en de intermoleculaire krachten te begrijpen.
·         Het concept van entropie te begrijpen in relatie tot biologische processen.
·         Waarom bepaalde processen wel en andere niet kunnen plaatsvinden (free energy)
·         Om de relatie tussen pH en lading van een eiwit te begrijpen
·         Thermodynamica te gebruiken om moleculaire interacties en biologische functie te begrijpen.
Inhoud
Deze cursus gaat over de fysische chemie van biologische moleculen en hoe we ze kunnen bestuderen. Zoals de interactie van licht met materie ons in staat stelt om de wereld te kunnen zien, bieden spectroscopische technieken enkele van de meest krachtige methoden voor het bepalen van de structuur en eigenschappen van biomoleculen. In onze cursus zul je vertrouwd worden met voorbeelden van dergelijke spectroscopische methoden en hoe we ze kunnen gebruiken om biologische moleculen op het meest gedetailleerde dwz atomaire niveau te kunnen zien. Structuur en functie van biologische systemen worden bepaald door de wisselwerking tussen thermische beweging en de verschillende krachten tussen de moleculen, zoals algemeen in de fysische werkelijkheid. Parallel aan de spectroscopie wordt een introductie in de thermodynamica gegeven. Daar worden de twee hoofdwetten van de thermodynamica behandeld: de eerste hoofdwet, behoud van energie, en de tweede hoofdwet, die een statistische basis heeft. Uit de tweede hoofdwet volgt dat bepaalde processen waarschijnlijk zijn en andere (zeer) onwaarschijnlijk. Via de hoofdwetten van de thermodynamica is het in principe mogelijk om de richting van een proces te voorspellen. Bij deze cursus zullen we ons concentreren op (bio) chemische reacties, binden van medicijnen aan eiwitten, eiwit vouwing, en redox potentialen.
 

Practicum
  1. Buffers en pH
  2. Colorimetrie (UV-vis), Lambert-Beer
    1. Maken van eigen Bradford reagens
    2. Bepalen van eiwit concentratie evt. vergelijken met afgewogen hoeveelheid. (foutenleer/statistiek)
  3. Binding experimenten
  4. Binding van DAPI aan DNA (Fluorescentie)
  5. Binding van Riboflavine aan Riboflavine Binding Protein (Absorptie)
  6. Binding van coumaric acid aan BSA (Fluorescentie)
  7. Labeling van Eiwit met bijv Dansyl chloride (binding van A22 aan BSA) (nog te testen)
  8. Eiwit zuivering (phycocyanin) en ontvouwing door omstandigheden (pH, hitte etc)
Ingangseisen
Verplicht materiaal
Boek
Garland Science & Organic Chemistry 7th or 8th Edition by John McMurry (ISBN: 0495118370)
Boek
Molecules of Life, J. Kuriyan, B. Konforti, D. Wemmer, 2013, Garland Science & Organic Chemistry 7th or 8th Edition by John McMurry (ISBN: 0495118370)
Onderzoeksrapportage
Professioneel labjournaal Breedfolio Atlanta 2104212600 96 blz
Boek
J.R. Dean et al.: Practical Skills in Chemistry, Prentice Hall, Pearson Education Ltd., UK, 2nd edition 2011
Handleiding
Dictaten en handleiding: "Meten en maken", departement Scheikunde U.U. (zie ook http://practicum//chem.uu.nl/
Werkvormen
Hoor/werkcollege

Hoorcollege 1

Hoorcollege 2

Practicum

Toetsen
Eindresultaat
Weging100
Minimum cijfer-

Beoordeling
Voldoende indien gemiddelde gewogen eindcijfer afgerond tenminste 6,0 is én de deelresultaten tenminste 5,0.

SluitenHelpPrint
Switch to English